我有这个 bitbucket 管道:图像:ubuntu:latestpipelines:分支:master:-步骤:名称:上传脚本:-apt-get update && apt-get insta...
我有这个 bitbucket 管道:
image: ubuntu:latest
pipelines:
branches:
master:
- step:
name: Upload
script:
- apt-get update && apt-get install -y openssh-client jq curl
- cat /opt/atlassian/pipelines/agent/ssh/id_rsa >> ec2_private_key.pem
- chmod 600 ec2_private_key.pem
- echo "Fetching modified files from Bitbucket API using diff endpoint"
- |
curl -s -H "Authorization: Bearer $API_TOKEN_BEARER" \
"https://api.bitbucket.org/2.0/repositories/$BITBUCKET_REPO_FULL_NAME/commits/master" \
| jq -r '.values[0].hash' > latest_commit.txt
- COMMIT_HASH=$(cat latest_commit.txt)
- |
curl -s -H "Authorization: Bearer $API_TOKEN_BEARER" \
"https://api.bitbucket.org/2.0/repositories/$BITBUCKET_REPO_FULL_NAME/diff/$COMMIT_HASH" \
| grep '^+++ b' | awk '{print $2}' | sed 's/^b\///' > modified_files.txt
- echo "Modified files:"
- cat modified_files.txt
- while IFS= read -r file; do
scp -i ec2_private_key.pem -o StrictHostKeyChecking=no -r "$file" ubuntu@$EC2_HOST:$PATH"$file";
done < modified_files.txt
- ssh -i ec2_private_key.pem -o StrictHostKeyChecking=no ubuntu@$EC2_HOST "cd $PATH && sudo docker-compose up --build -d"
这与我在另一个存储库中拥有的另一个管道非常相似,并且已经可以正常工作。但是,执行管道时似乎未正确安装映像。在构建设置中,我收到此错误:
使用的图像:构建:docker.io/library/ubuntu@sha256:bash:dircolors:未找到命令
在 apt-get 行中我收到此错误:
- apt-get update && apt-get install -y openssh-client jq curlbash:apt-get:未找到命令
大家好,我怎样才能将所有名为 \'ATAC\' 的文件和所有名为 \'RNA\' 的文件移动到单独的文件夹中?上下文是,在当前目录中,我有很多
大家好,我怎样才能将所有名为 \'ATAC\' 的文件和所有名为 \'RNA\' 的文件移动到单独的文件夹中?上下文是,在当前目录中,我有许多子目录,其中包含名称中带有 \'ATAC\' 和 \'RNA\' 的 fastq 文件;如果文件位于目录中而不是存储在其他目录中,那么这将很容易,我只需使用 RNA* 和 ATAC* 选择文件即可,但问题是它们存储在子目录中;在这种情况下,我怎样才能选择 2 个文件子集并将它们移动到新的单独文件夹(一个用于 ATAC,一个用于 RNA)中?